Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTNNA3Q9UI47 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTNNA3Q9UI47 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms