Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MLH3Q9UHC1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms