Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
KDM5BQ9UGL1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDM5BQ9UGL1 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms