Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM248Q9NWD8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms