Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
KRT84Q9NSB2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms