Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFGAP3Q9NP61 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms