Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PTPRHQ9HD43 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms