Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NXF3Q9H4D5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms