Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL4Q9C0H6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms