Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FOXQ1Q9C009 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FOXQ1Q9C009 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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