Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BCO2Q9BYV7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms