Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLVAPQ9BX97 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms