Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP4Q9BWG4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms