Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IFT27Q9BW83 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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