Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CHCHD7Q9BUK0 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms