Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
UPK3BQ9BT76 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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