Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NICN1Q9BSH3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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