Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FYCO1Q9BQS8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FYCO1Q9BQS8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms