Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PITX2Q99697 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.3 ms