Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAT1Q99536 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms