Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NELL2Q99435 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms