Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIN3AQ96ST3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SIN3AQ96ST3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms