Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SAMD8Q96LT4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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SAMD8Q96LT4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAMD8Q96LT4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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