Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC45A3Q96JT2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLC45A3Q96JT2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms