Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC97Q96F63 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC97Q96F63 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms