Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
RNFT2Q96EX2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RNFT2Q96EX2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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