Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGF29Q96ES7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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