Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPTSSAQ969W0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPTSSAQ969W0 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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