Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTTNBP2Q8WZ74 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms