Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC44A1Q8WWI5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms