Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GDPD1Q8N9F7 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms