Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNMB4Q86W47 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms