Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HAPLN4Q86UW8 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms