Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTF1AQ7RTS3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms