Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HECW1Q76N89 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HECW1Q76N89 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms