Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAD11Q709F0 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms