Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SUSD1Q6UWL2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms