Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARMIL2Q6F5E8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms