Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUPD1Q68J44 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms