Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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COL5A1-AS1Q5SY13 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
COL5A1-AS1Q5SY13 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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