Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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RAB6CQ53S08 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB6CQ53S08 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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