Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTXN3Q4LDR2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms