Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM16LQ309B1 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms