Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COL24A1Q17RW2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
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COL24A1Q17RW2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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COL24A1Q17RW2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL24A1Q17RW2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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