Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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