Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDO1Q16878 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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