Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CA9Q16790 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CA9Q16790 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CA9Q16790 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CA9Q16790 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CA9Q16790 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CA9Q16790 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CA9Q16790 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CA9Q16790 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CA9Q16790 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CA9Q16790 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CA9Q16790 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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CA9Q16790 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CA9Q16790 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CA9Q16790 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CA9Q16790 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CA9Q16790 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CA9Q16790 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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