Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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ZNF239Q16600 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ZNF239Q16600 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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