Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ZNF56Q15929 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms