Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZIC1Q15915 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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ZIC1Q15915 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZIC1Q15915 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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